Os espaços dos laboratórios, núcleos e grupos de pesquisa estão vinculados às atividades dos docentes e discentes do PROFGEO. O espaço físico destinado encontra-se organizado em função da natureza e das necessidades das pesquisas realizadas. A infraestrutura dos mesmos tem sido permanentemente melhorada conforme são aprovados seus projetos junto a órgãos de fomento internos e externos às instituições associadas.
Os laboratórios possuem as condições necessárias para o adequado desenvolvimento dos trabalhos de conclusão de curso e das demais pesquisas realizadas por discentes e docentes. Entre os Laboratórios da UFPA aos quais o PROFGEO possui acesso cabe destacar:
a) Laboratório de Ensino e Aprendizagem em Geografia (LEAGEO) – Campus Ananindeua, UFPA;
b) Laboratório de Geoprocessamento (LABGEO) – Campus Ananindeua, UFPA;
c) Laboratório de Humanidades Amazônicas (LABHAM) – Campus Ananindeua, UFPA;
d) Laboratório de Informática (LABINFO) – Campus Ananindeua, UFPA;
e) Laboratório de Prática de Ensino de Geografia (LABPRAT), Campus Altamira, UFPA;
f) Laboratório de Geografia Física e Cartografia (LAGEO) – Campus Altamira, UFPA;
g) Laboratório de Ensino – Campus Cametá, UFPA;
h) Laboratório de Informática – Campus Cametá, UFPA;
i) Laboratório de Análise Ambiental e Representação Cartográfica – Núcleo de Meio Ambiente, UFPA.